O processo de criação da Agência de Fomento do Estado de Pernambuco S/A (AGEFEPE) teve início no dia 24 de março de 2008, quando o governador Eduardo Campos assinou o decreto  31.548/08, que instituiu o grupo de trabalho responsável por formular o modelo conceitual da agência que os empresários pernambucanos precisavam.

O segundo passo legal para criação da AGEFEPE ocorreu ainda em 2008, no dia 18 de dezembro, quando a Assembleia Legislativa autorizou o Poder Executivo, através da Lei 13.701/08, a constituir a Agência sob a forma de uma sociedade de economia mista e de capital fechado, sujeita ao controle majoritário do Estado.

Em seguida foi assinado o Decreto 35.156/10, em 11 de junho de 2010. Com essa publicação, a AGEFEPE foi legalmente criada como instituição financeira sintonizada com a missão do governo estadual de reduzir as desigualdades existentes nas diferentes Regiões de Desenvolvimento de Pernambuco e criar condições para um crescimento mais equilibrado e justo.

Como parte do processo de implantação da AGEFEPE, recebeu autorização de funcionamento do Banco Central do Brasil (BACEN) em dezembro de 2010. Tendo sido inaugurada oficialmente, no dia 25 de agosto de 2011.